RDKit
Open-source cheminformatics and machine learning.
- g -
GaResult() :
RDKit::GaResult
GasteigerParams() :
RDKit::GasteigerParams
gather() :
ForceFields::ForceField
generateNext() :
RDKit::FMCS::Composition2N
get() :
RDKit::MolAlign::MolHistogram
getAbundanceForIsotope() :
RDKit::PeriodicTable
getActiveAtmIdx1() :
RDKit::MolDraw2D
getActiveAtmIdx2() :
RDKit::MolDraw2D
getActiveAtom() :
RDKit::RWMol
getActiveBndIdx() :
RDKit::MolDraw2D
getActiveClass() :
RDKit::MolDraw2D
getActiveConformer() :
RDKit::MolChemicalFeature
getAgents() :
RDKit::ChemicalReaction
getAllAtomsWithBookmark() :
RDKit::ROMol
getAllBondsWithBookmark() :
RDKit::ROMol
getAltLoc() :
RDKit::AtomPDBResidueInfo
getAtIdx() :
RDKit::RecursiveStructureQuery
getAtom() :
RDKit::CIPLabeler::CIPMol
,
RDKit::CIPLabeler::Node
getAtomBonds() :
RDKit::ROMol
getAtomBookmarks() :
RDKit::ROMol
getAtomConjGrpIdx() :
RDKit::ResonanceMolSupplier
getAtomCoords() :
RDKit::MolDraw2D
,
RDKit::MolDraw2D_detail::DrawMol
getAtomDegree() :
RDKit::ROMol
getAtomicMass() :
RDKit::CIPLabeler::Node
getAtomicNum() :
RDKit::Atom
,
RDKit::CIPLabeler::Node
getAtomicNumber() :
RDKit::PeriodicTable
getAtomicNumFraction() :
RDKit::CIPLabeler::Node
getAtomicWeight() :
RDKit::PeriodicTable
getAtomIdx() :
RDKit::AtomSanitizeException
getAtomIndices() :
RDKit::KekulizeException
getAtomInvariants() :
RDKit::AtomInvariantsGenerator
,
RDKit::AtomPair::AtomPairAtomInvGenerator
,
RDKit::MorganFingerprint::MorganAtomInvGenerator
,
RDKit::MorganFingerprint::MorganFeatureAtomInvGenerator
,
RDKit::RDKitFP::RDKitFPAtomInvGenerator
getAtomMapNum() :
RDKit::Atom
getAtomNeighbors() :
RDKit::ROMol
getAtomOrientation() :
RDKit::MolDraw2D_detail::DrawMol
getAtomPos() :
RDKit::Conformer
getAtoms() :
RDKit::MolChemicalFeature
,
RDKit::StereoGroup
,
RDKit::SubstanceGroup
getAtomSymbol() :
RDKit::MolDraw2D_detail::DrawMol
getAtomSymbolAndOrientation() :
RDKit::MolDraw2D_detail::DrawMol
getAtomWithBookmark() :
RDKit::ROMol
getAtomWithIdx() :
RDKit::ROMol
getAttachPoints() :
RDKit::SubstanceGroup
getAux() :
RDKit::CIPLabeler::Edge
,
RDKit::CIPLabeler::Node
getAvailableProperties() :
RDKit::Descriptors::Properties
getBeg() :
RDKit::CIPLabeler::Edge
getBeginAtom() :
RDKit::Bond
getBeginAtomIdx() :
RDKit::Bond
getBestPermutation() :
RDKit::RGroupScorer
getBestScore() :
RDKit::RGroupScorer
getBit() :
BitVect
,
ExplicitBitVect
,
SparseBitVect
getBitId() :
RDCatalog::CatalogEntry
,
RDKit::AtomEnvironment< OutputType >
,
RDKit::AtomPair::AtomPairAtomEnv< OutputType >
,
RDKit::MorganFingerprint::MorganAtomEnv< OutputType >
,
RDKit::RDKitFP::RDKitFPAtomEnv< OutputType >
,
RDKit::TopologicalTorsion::TopologicalTorsionAtomEnv< OutputType >
getBitSet() :
RDKit::FMCS::Composition2N
,
SparseBitVect
getBond() :
RDKit::CIPLabeler::CIPMol
,
RDKit::CIPLabeler::Edge
getBondBetweenAtoms() :
RDKit::ROMol
getBondBookmarks() :
RDKit::ROMol
getBondColours() :
RDKit::MolDraw2D_detail::DrawMol
getBondConjGrpIdx() :
RDKit::ResonanceMolSupplier
getBondDir() :
RDKit::Bond
getBondInvariants() :
RDKit::BondInvariantsGenerator
,
RDKit::MorganFingerprint::MorganBondInvGenerator
getBondLabel() :
RDKit::CIPLabeler::SequenceRule
getBondOrder() :
RDKit::CIPLabeler::CIPMol
getBonds() :
RDKit::CIPLabeler::CIPMol
,
RDKit::SubstanceGroup
getBondType() :
RDKit::Bond
,
RDKit::SubstanceGroup
getBondTypeAsDouble() :
RDKit::Bond
getBondWithBookmark() :
RDKit::ROMol
getBondWithIdx() :
RDKit::ROMol
getBoxNx() :
RDDepict::EmbeddedFrag
getBoxNy() :
RDDepict::EmbeddedFrag
getBoxPx() :
RDDepict::EmbeddedFrag
getBoxPy() :
RDDepict::EmbeddedFrag
getBrackets() :
RDKit::SubstanceGroup
getBytes() :
RDKit::FPBReader
getCallback() :
RDKit::MolStandardize::TautomerEnumerator
getCarriers() :
RDKit::CIPLabeler::Configuration
getCatalogParams() :
RDCatalog::Catalog< entryType, paramType >
getCatalogs() :
RDKit::FilterCatalogParams
getChainId() :
RDKit::AtomPDBResidueInfo
GetCharges() :
MolData3Ddescriptors
getChiralTag() :
RDKit::Atom
getChromosomePolicy() :
RDKit::RGroupGa
getCol() :
RDNumeric::Matrix< TYPE >
,
RDNumeric::SymmMatrix< TYPE >
getComparision() :
RDKit::CIPLabeler::Rules
,
RDKit::CIPLabeler::SequenceRule
getConformer() :
RDKit::ROMol
getContainingNeighbors() :
RDKit::FPBReader
,
RDKit::MultiFPBReader
getCorrBitList() :
RDInfoTheory::BitCorrMatGenerator
getCorrMat() :
RDInfoTheory::BitCorrMatGenerator
getCost() :
RDKit::MolAlign::LAP
getCountFingerprint() :
RDKit::FingerprintGenerator< OutputType >
getCStates() :
RDKit::SubstanceGroup
GetCurrentBestPermutation() :
RDKit::RGroupDecompData
getCurrentRoot() :
RDKit::CIPLabeler::Digraph
GetCustomAtomProp() :
MolData3Ddescriptors
getCustomPropHandlers() :
RDKit::MolPickler
getData() :
RDKit::Dict
,
RDKit::DiscreteValueVect
,
RDNumeric::Matrix< TYPE >
,
RDNumeric::SymmMatrix< TYPE >
,
RDNumeric::Vector< TYPE >
getDataSize() :
RDNumeric::Matrix< TYPE >
,
RDNumeric::SymmMatrix< TYPE >
getDefaultPickleProperties() :
RDKit::MolPickler
getDefaultValence() :
RDKit::PeriodicTable
getDegree() :
RDKit::Atom
getDescription() :
Queries::Query< MatchFuncArgType, DataFuncArgType, needsConversion >
,
RDCatalog::CatalogEntry
,
RDKit::FilterCatalogEntry
,
RDKit::FragCatalogEntry
,
RDKit::MolCatalogEntry
getDict() :
RDKit::RDProps
getDigraph() :
RDKit::CIPLabeler::Configuration
,
RDKit::CIPLabeler::Node
getDimensions() :
RDKit::MolDraw2D_detail::DrawAnnotation
getDirs() :
RDFeatures::ExplicitFeature< FAMILYMARKER, TYPEMARKER, LOCTYPE >
,
RDFeatures::ImplicitFeature< FAMILYMARKER, TYPEMARKER, LOCTYPE >
getDiscrims() :
RDKit::FragCatalogEntry
getDist() :
RDKit::DiscreteDistMat
getDistance() :
RDKit::CIPLabeler::Node
getDownEntryList() :
RDCatalog::HierarchCatalog< entryType, paramType, orderType >
getDrawCoords() :
RDKit::MolDraw2D
,
RDKit::MolDraw2D_detail::DrawMol
getDrawingText() :
RDKit::MolDraw2DCairo
,
RDKit::MolDraw2DSVG
getDrawLineWidth() :
RDKit::MolDraw2D
getDrawTransformers() :
RDKit::MolDraw2D_detail::DrawMol
getEdges() :
RDKit::CIPLabeler::Node
,
RDKit::ROMol
getElementSymbol() :
RDKit::PeriodicTable
GetEmbeddedAtom() :
RDDepict::EmbeddedFrag
GetEmbeddedAtoms() :
RDDepict::EmbeddedFrag
getEnd() :
RDKit::CIPLabeler::Edge
getEndAtom() :
RDKit::Bond
getEndAtomIdx() :
RDKit::Bond
getEndsOpen() :
Queries::RangeQuery< MatchFuncArgType, DataFuncArgType, needsConversion >
getEnergy() :
DistGeom::ChiralViolationContrib
,
DistGeom::DistViolationContrib
,
DistGeom::FourthDimContrib
,
ForceFields::CrystalFF::TorsionAngleContribM6
,
ForceFields::ForceFieldContrib
,
ForceFields::MMFF::AngleBendContrib
,
ForceFields::MMFF::AngleConstraintContrib
,
ForceFields::MMFF::BondStretchContrib
,
ForceFields::MMFF::DistanceConstraintContrib
,
ForceFields::MMFF::EleContrib
,
ForceFields::MMFF::OopBendContrib
,
ForceFields::MMFF::PositionConstraintContrib
,
ForceFields::MMFF::StretchBendContrib
,
ForceFields::MMFF::TorsionAngleContrib
,
ForceFields::MMFF::TorsionConstraintContrib
,
ForceFields::MMFF::VdWContrib
,
ForceFields::UFF::AngleBendContrib
,
ForceFields::UFF::AngleConstraintContrib
,
ForceFields::UFF::BondStretchContrib
,
ForceFields::UFF::DistanceConstraintContrib
,
ForceFields::UFF::InversionContrib
,
ForceFields::UFF::PositionConstraintContrib
,
ForceFields::UFF::TorsionAngleContrib
,
ForceFields::UFF::TorsionConstraintContrib
,
ForceFields::UFF::vdWContrib
,
RDKit::Snapshot
getEntriesOfOrder() :
RDCatalog::HierarchCatalog< entryType, paramType, orderType >
getEntry() :
RDKit::FilterCatalog
getEntryWithBitId() :
RDCatalog::HierarchCatalog< entryType, paramType, orderType >
getEntryWithIdx() :
RDCatalog::Catalog< entryType, paramType >
,
RDCatalog::HierarchCatalog< entryType, paramType, orderType >
,
RDKit::FilterCatalog
getEnumerator() :
RDKit::EnumerateLibraryBase
getEnvironments() :
RDKit::AtomEnvironmentGenerator< OutputType >
,
RDKit::AtomPair::AtomPairEnvGenerator< OutputType >
,
RDKit::MorganFingerprint::MorganEnvGenerator< OutputType >
,
RDKit::RDKitFP::RDKitFPEnvGenerator< OutputType >
,
RDKit::TopologicalTorsion::TopologicalTorsionEnvGenerator< OutputType >
getEOFHitOnRead() :
RDKit::ForwardSDMolSupplier
GetEState() :
MolData3Ddescriptors
GetEState2() :
MolData3Ddescriptors
getExplicitValence() :
RDKit::Atom
getExpression() :
Invar::Invariant
getFactory() :
RDKit::MolChemicalFeature
getFamily() :
ChemicalFeatures::ChemicalFeature
,
ChemicalFeatures::FreeChemicalFeature
,
RDFeatures::ExplicitFeature< FAMILYMARKER, TYPEMARKER, LOCTYPE >
,
RDFeatures::ImplicitFeature< FAMILYMARKER, TYPEMARKER, LOCTYPE >
,
RDKit::MolChemicalFeature
,
RDKit::MolChemicalFeatureDef
getFeatDef() :
RDKit::MolChemicalFeature
getFeaturesForMol() :
RDKit::MolChemicalFeatureFactory
getFile() :
Invar::Invariant
getFilterMatches() :
RDKit::FilterCatalog
,
RDKit::FilterCatalogEntry
getFingerprint() :
RDKit::FingerprintGenerator< OutputType >
,
RDKit::FPHolderBase
getFingerprints() :
RDKit::FPHolderBase
,
RDKit::SubstructLibrary
getFingerprintVarianceScoreData() :
RDKit::RGroupDecompositionChromosome
getFirstMatch() :
RDKit::FilterCatalog
getFitness() :
RDKit::RGroupDecompositionChromosome
getFoci() :
RDKit::CIPLabeler::Configuration
getFocus() :
RDKit::CIPLabeler::Configuration
getFontFile() :
RDKit::MolDraw2D_detail::DrawText
,
RDKit::MolDraw2D_detail::DrawTextFT
getFontScale() :
RDKit::MolDraw2D_detail::DrawMol
getForceV3000() :
RDKit::SDWriter
getFormalCharge() :
RDKit::Atom
getFP() :
RDKit::FPBReader
getFPForMol() :
RDKit::FragFPGenerator
getFpHolder() :
RDKit::SubstructLibrary
getFPIdsInCountRange() :
RDKit::FPBReader
getFPLength() :
RDCatalog::Catalog< entryType, paramType >
getFractionalAtomicNum() :
RDKit::CIPLabeler::CIPMol
getFullDescription() :
Queries::EqualityQuery< MatchFuncArgType, DataFuncArgType, needsConversion >
,
Queries::GreaterEqualQuery< MatchFuncArgType, DataFuncArgType, needsConversion >
,
Queries::GreaterQuery< MatchFuncArgType, DataFuncArgType, needsConversion >
,
Queries::LessEqualQuery< MatchFuncArgType, DataFuncArgType, needsConversion >
,
Queries::LessQuery< MatchFuncArgType, DataFuncArgType, needsConversion >
,
Queries::Query< MatchFuncArgType, DataFuncArgType, needsConversion >
,
Queries::RangeQuery< MatchFuncArgType, DataFuncArgType, needsConversion >
,
Queries::SetQuery< MatchFuncArgType, DataFuncArgType, needsConversion >
getFuncGroup() :
RDKit::FragCatParams
,
RDKit::MolStandardize::FragmentCatalogParams
getFuncGroupMap() :
RDKit::FragCatalogEntry
getFuncGroups() :
RDKit::FragCatParams
,
RDKit::MolStandardize::FragmentCatalogParams
getGrad() :
DistGeom::ChiralViolationContrib
,
DistGeom::DistViolationContrib
,
DistGeom::FourthDimContrib
,
ForceFields::CrystalFF::TorsionAngleContribM6
,
ForceFields::ForceFieldContrib
,
ForceFields::MMFF::AngleBendContrib
,
ForceFields::MMFF::AngleConstraintContrib
,
ForceFields::MMFF::BondStretchContrib
,
ForceFields::MMFF::DistanceConstraintContrib
,
ForceFields::MMFF::EleContrib
,
ForceFields::MMFF::OopBendContrib
,
ForceFields::MMFF::PositionConstraintContrib
,
ForceFields::MMFF::StretchBendContrib
,
ForceFields::MMFF::TorsionAngleContrib
,
ForceFields::MMFF::TorsionConstraintContrib
,
ForceFields::MMFF::VdWContrib
,
ForceFields::UFF::AngleBendContrib
,
ForceFields::UFF::AngleConstraintContrib
,
ForceFields::UFF::BondStretchContrib
,
ForceFields::UFF::DistanceConstraintContrib
,
ForceFields::UFF::InversionContrib
,
ForceFields::UFF::PositionConstraintContrib
,
ForceFields::UFF::TorsionAngleContrib
,
ForceFields::UFF::TorsionConstraintContrib
,
ForceFields::UFF::vdWContrib
getGridIndex() :
RDGeom::UniformGrid3D
getGridIndices() :
RDGeom::UniformGrid3D
getGridPointIndex() :
RDGeom::Grid3D
,
RDGeom::UniformGrid3D
getGridPointLoc() :
RDGeom::Grid3D
,
RDGeom::UniformGrid3D
getGroups() :
RDKit::CIPLabeler::Sort
getGroupType() :
RDKit::StereoGroup
getHybridization() :
RDKit::Atom
getId() :
ChemicalFeatures::ChemicalFeature
,
ChemicalFeatures::FreeChemicalFeature
,
RDKit::Conformer
,
RDKit::FPBReader
,
RDKit::MolChemicalFeature
getIdOfEntryWithBitId() :
RDCatalog::HierarchCatalog< entryType, paramType, orderType >
getIdx() :
RDKit::Atom
,
RDKit::Bond
getIdxForEntry() :
RDKit::FilterCatalog
getImplicitPropertiesFlag() :
RDKit::ChemicalReaction
getImplicitValence() :
RDKit::Atom
getIndexInMol() :
RDKit::SubstanceGroup
getInsertionCode() :
RDKit::AtomPDBResidueInfo
getIonPOL() :
Data3Ddescriptors
getIsAromatic() :
RDKit::Atom
,
RDKit::Bond
getIsConjugated() :
RDKit::Bond
getIsEnumerated() :
RDKit::ResonanceMolSupplier
getIsHeteroAtom() :
RDKit::AtomPDBResidueInfo
getIsotope() :
RDKit::Atom
GetIState() :
MolData3Ddescriptors
GetIStateDrag() :
MolData3Ddescriptors
getIsUsed() :
RDKit::UsedLabelMap
getIsValid() :
RDKit::SubstanceGroup
getItemText() :
RDKit::SDMolSupplier
,
RDKit::SmilesMolSupplier
,
RDKit::TDTMolSupplier
getKekulize() :
RDKit::SDWriter
getKey() :
RDKit::KeyFromPropHolder
,
RDKit::KeyHolderBase
getKeyHolder() :
RDKit::SubstructLibrary
getKeys() :
RDKit::KeyFromPropHolder
,
RDKit::KeyHolderBase
,
RDKit::SubstructLibrary
getLabelSize() :
RDKit::MolDraw2D
getLastAtom() :
RDKit::RWMol
getLength() :
RDKit::DiscreteValueVect
,
RDKit::SparseIntVect< IndexType >
getLine() :
Invar::Invariant
getLoc() :
RDFeatures::ExplicitFeature< FAMILYMARKER, TYPEMARKER, LOCTYPE >
,
RDFeatures::ImplicitFeature< FAMILYMARKER, TYPEMARKER, LOCTYPE >
getLower() :
Queries::RangeQuery< MatchFuncArgType, DataFuncArgType, needsConversion >
getLowerBound() :
DistGeom::BoundsMatrix
getLowerFragLength() :
RDKit::FragCatParams
getLowerVolumeBound() :
DistGeom::ChiralSet
getMass() :
RDKit::Atom
getMassForIsotope() :
RDKit::PeriodicTable
getMassNum() :
RDKit::CIPLabeler::Node
getMatcher() :
RDKit::MorganFingerprints::ss_matcher
getMatches() :
RDKit::ExclusionList
,
RDKit::FilterCatalog
,
RDKit::FilterHierarchyMatcher
,
RDKit::FilterMatcherBase
,
RDKit::FilterMatchOps::And
,
RDKit::FilterMatchOps::Not
,
RDKit::FilterMatchOps::Or
,
RDKit::SmartsMatcher
,
RDKit::SubstructLibrary
getMaxCount() :
RDKit::SmartsMatcher
getMaxNumberAtoms() :
RDKit::FMCS::MaximumCommonSubgraph
getMaxNumberBonds() :
RDKit::FMCS::MaximumCommonSubgraph
getMaxStructures() :
RDKit::ResonanceMolSupplierCallback
getMaxTautomers() :
RDKit::MolStandardize::TautomerEnumerator
getMaxTransforms() :
RDKit::MolStandardize::TautomerEnumerator
getMetalNof() :
RDKit::MolStandardize::MetalDisconnector
getMetalNon() :
RDKit::MolStandardize::MetalDisconnector
getMinCount() :
RDKit::SmartsMatcher
getMMFFAngleBendParams() :
RDKit::MMFF::MMFFMolProperties
getMMFFAngleTerm() :
RDKit::MMFF::MMFFMolProperties
getMMFFAngleType() :
RDKit::MMFF::MMFFMolProperties
getMMFFAtomType() :
RDKit::MMFF::MMFFMolProperties
getMMFFBondStretchEmpiricalRuleParams() :
RDKit::MMFF::MMFFMolProperties
getMMFFBondStretchParams() :
RDKit::MMFF::MMFFMolProperties
getMMFFBondTerm() :
RDKit::MMFF::MMFFMolProperties
getMMFFBondType() :
RDKit::MMFF::MMFFMolProperties
getMMFFChgParams() :
ForceFields::MMFF::MMFFChgCollection
getMMFFDfsbParams() :
ForceFields::MMFF::MMFFDfsbCollection
getMMFFDielectricConstant() :
RDKit::MMFF::MMFFMolProperties
getMMFFDielectricModel() :
RDKit::MMFF::MMFFMolProperties
getMMFFEleTerm() :
RDKit::MMFF::MMFFMolProperties
getMMFFFormalCharge() :
RDKit::MMFF::MMFFMolProperties
getMMFFOopBendParams() :
RDKit::MMFF::MMFFMolProperties
getMMFFOopTerm() :
RDKit::MMFF::MMFFMolProperties
getMMFFOStream() :
RDKit::MMFF::MMFFMolProperties
getMMFFPartialCharge() :
RDKit::MMFF::MMFFMolProperties
getMMFFStbnParams() :
ForceFields::MMFF::MMFFStbnCollection
getMMFFStretchBendParams() :
RDKit::MMFF::MMFFMolProperties
getMMFFStretchBendTerm() :
RDKit::MMFF::MMFFMolProperties
getMMFFTorParams() :
ForceFields::MMFF::MMFFTorCollection
getMMFFTorsionEmpiricalRuleParams() :
RDKit::MMFF::MMFFMolProperties
getMMFFTorsionParams() :
RDKit::MMFF::MMFFMolProperties
getMMFFTorsionTerm() :
RDKit::MMFF::MMFFMolProperties
getMMFFTorsionType() :
RDKit::MMFF::MMFFMolProperties
getMMFFVariant() :
RDKit::MMFF::MMFFMolProperties
getMMFFVdWParams() :
RDKit::MMFF::MMFFMolProperties
getMMFFVdWTerm() :
RDKit::MMFF::MMFFMolProperties
getMMFFVerbosity() :
RDKit::MMFF::MMFFMolProperties
getModifiedAtoms() :
RDKit::TautomerQuery
getModifiedBonds() :
RDKit::TautomerQuery
getMol() :
RDDepict::EmbeddedFrag
,
RDKit::CachedMolHolder
,
RDKit::CachedSmilesMolHolder
,
RDKit::CachedTrustedSmilesMolHolder
,
RDKit::CIPLabeler::Digraph
,
RDKit::MolBundle
,
RDKit::MolCatalogEntry
,
RDKit::MolChemicalFeature
,
RDKit::MolHolder
,
RDKit::MolHolderBase
,
RDKit::SubstructLibrary
getMolecules() :
RDKit::SubstructLibrary
getMolHolder() :
RDKit::SubstructLibrary
getMols() :
RDKit::CachedMolHolder
,
RDKit::CachedSmilesMolHolder
,
RDKit::CachedTrustedSmilesMolHolder
,
RDKit::MolBundle
,
RDKit::MolHolder
getMonomerInfo() :
RDKit::Atom
getMonomerType() :
RDKit::AtomMonomerInfo
getMostCommonIsotope() :
RDKit::PeriodicTable
getMostCommonIsotopeMass() :
RDKit::PeriodicTable
getMW() :
Data3Ddescriptors
getName() :
RDKit::AtomMonomerInfo
,
RDKit::Descriptors::PropertyFunctor
,
RDKit::ExclusionList
,
RDKit::FilterHierarchyMatcher
,
RDKit::FilterMatcherBase
,
RDKit::FilterMatchOps::And
,
RDKit::FilterMatchOps::Not
,
RDKit::FilterMatchOps::Or
getNEG() :
Data3Ddescriptors
getNegation() :
Queries::Query< MatchFuncArgType, DataFuncArgType, needsConversion >
getNeighbors() :
RDKit::CIPLabeler::CIPMol
getNodes() :
RDKit::CIPLabeler::Digraph
getNoImplicit() :
RDKit::Atom
getNonPODStatus() :
RDKit::Dict
getNonTerminalOutEdges() :
RDKit::CIPLabeler::Node
getNonzeroElements() :
RDKit::SparseIntVect< IndexType >
getNoteStartAngle() :
RDKit::MolDraw2D_detail::DrawMol
getNouterElecs() :
RDKit::PeriodicTable
getNumAgentTemplates() :
RDKit::ChemicalReaction
getNumAtoms() :
RDKit::CIPLabeler::CIPMol
,
RDKit::Conformer
,
RDKit::FMCS::DuplicatedSeedCache::TKey
,
RDKit::FMCS::Seed
,
RDKit::MolChemicalFeature
,
RDKit::ROMol
getNumBits() :
BitVect
,
ExplicitBitVect
,
RDKit::PatternHolder
,
SparseBitVect
getNumBitsPerVal() :
RDKit::DiscreteValueVect
getNumBonds() :
RDKit::CIPLabeler::CIPMol
,
RDKit::FMCS::DuplicatedSeedCache::TKey
,
RDKit::FMCS::Seed
,
RDKit::ROMol
getNumBondsToRlabels() :
RDKit::RGroupData
getNumClasses() :
RDInfoTheory::InfoBitRanker
getNumConformers() :
RDKit::ROMol
getNumConjGrps() :
RDKit::ResonanceMolSupplier
,
RDKit::ResonanceMolSupplierCallback
getNumDigits() :
RDKit::TDTWriter
getNumDiverseStructures() :
RDKit::ResonanceMolSupplierCallback
getNumEntries() :
RDCatalog::Catalog< entryType, paramType >
,
RDCatalog::HierarchCatalog< entryType, paramType, orderType >
,
RDKit::FilterCatalog
getNumExamples() :
RDInfoTheory::BitCorrMatGenerator
getNumExplicitHs() :
RDKit::Atom
getNumFeatureDefs() :
RDKit::MolChemicalFeatureFactory
getNumFuncGroups() :
RDKit::FragCatParams
,
RDKit::MolStandardize::FragmentCatalogParams
getNumHeavyAtoms() :
RDKit::ROMol
getNumImplicitHs() :
RDKit::Atom
getNumInstances() :
RDInfoTheory::InfoBitRanker
getNumInts() :
RDKit::DiscreteValueVect
getNumNodes() :
RDKit::CIPLabeler::Digraph
getNumOffBits() :
BitVect
,
ExplicitBitVect
,
SparseBitVect
getNumOnBits() :
BitVect
,
ExplicitBitVect
,
SparseBitVect
getNumPairs() :
RDKit::MolStandardize::AcidBaseCatalogParams
getNumPermutations() :
RDKit::EnumerationStrategyBase
getNumProductTemplates() :
RDKit::ChemicalReaction
getNumRadicalElectrons() :
RDKit::Atom
getNumReactantTemplates() :
RDKit::ChemicalReaction
getNumStructures() :
RDKit::ResonanceMolSupplierCallback
getNumSubRules() :
RDKit::CIPLabeler::Rules
getNumTransformations() :
RDKit::MolStandardize::TransformCatalogParams
getNumWeights() :
RDKit::MolChemicalFeatureDef
getNumX() :
RDGeom::UniformGrid3D
getNumY() :
RDGeom::UniformGrid3D
getNumZ() :
RDGeom::UniformGrid3D
getOccupancy() :
RDKit::AtomPDBResidueInfo
getOccupancyVect() :
RDGeom::Grid3D
,
RDGeom::UniformGrid3D
getOffset() :
RDGeom::UniformGrid3D
getOnBits() :
BitVect
,
ExplicitBitVect
,
SparseBitVect
getOperationName() :
RDKit::RGroupDecompositionChromosome
getOperations() :
RDKit::RGroupGa
GetOptions() :
RDKit::StructureCheck::StructChecker
getOrder() :
RDKit::FragCatalogEntry
,
RDKit::MolCatalogEntry
,
RDKit::MolStandardize::AcidBaseCatalogEntry
,
RDKit::MolStandardize::FragmentCatalogEntry
,
RDKit::MolStandardize::TautomerCatalogEntry
,
RDKit::MolStandardize::TransformCatalogEntry
getOriginalRoot() :
RDKit::CIPLabeler::Digraph
getOther() :
RDKit::CIPLabeler::Edge
getOtherAtom() :
RDKit::Bond
getOtherAtomIdx() :
RDKit::Bond
getOwningMol() :
RDKit::Atom
,
RDKit::Bond
,
RDKit::Conformer
,
RDKit::SubstanceGroup
getPair() :
RDKit::MolStandardize::AcidBaseCatalogParams
getPairing() :
RDKit::CIPLabeler::PairList
getPairs() :
RDKit::MolStandardize::AcidBaseCatalogParams
getParams() :
ForceFields::UFF::ParamCollection
,
RDKit::Descriptors::CrippenParamCollection
,
RDKit::GasteigerParams
getParentAtoms() :
RDKit::SubstanceGroup
getPattern() :
RDKit::MolChemicalFeatureDef
,
RDKit::SmartsMatcher
getPermutation() :
RDKit::RGroupDecompositionChromosome
getPermutationIdx() :
RDKit::CartesianProductStrategy
,
RDKit::EnumerationStrategyBase
,
RDKit::EvenSamplePairsStrategy
,
RDKit::RandomSampleAllBBsStrategy
,
RDKit::RandomSampleStrategy
getPerpendicular() :
RDGeom::Point3D
getPerturbationOrder() :
RDKit::Atom
getPoint2D() :
RDKit::Snapshot
getPoint3D() :
RDKit::Snapshot
getPOL() :
Data3Ddescriptors
getPos() :
ChemicalFeatures::ChemicalFeature
,
ChemicalFeatures::FreeChemicalFeature
,
RDKit::MolChemicalFeature
getPosition() :
RDKit::EnumerateLibraryBase
,
RDKit::EnumerationStrategyBase
getPositions() :
RDKit::Conformer
getPrbIdx() :
RDKit::MolAlign::O3AConstraint
GetPrincipalQuantumNumber() :
MolData3Ddescriptors
getProcessPropertyLists() :
RDKit::ForwardSDMolSupplier
getProducts() :
RDKit::ChemicalReaction
getProgressCallback() :
RDKit::ResonanceMolSupplier
getProp() :
RDKit::FilterCatalogEntry
,
RDKit::FragCatalogEntry
,
RDKit::MolCatalogEntry
,
RDKit::RDProps
getProperty() :
RDKit::Descriptors::Properties
getPropertyNames() :
RDKit::Descriptors::Properties
getPropIfPresent() :
RDKit::FilterCatalogEntry
,
RDKit::RDProps
getPropList() :
RDKit::FilterCatalogEntry
,
RDKit::RDProps
getPropName() :
RDKit::CustomPropHandler
,
RDKit::DataStructsExplicitBitVecPropHandler
,
RDKit::KeyFromPropHolder
getProps() :
RDKit::FilterCatalogEntry
getQuery() :
RDKit::Atom
,
RDKit::Bond
,
RDKit::QueryAtom
,
RDKit::QueryBond
getQueryBondRings() :
RDKit::FMCS::RingMatchTableSet
getQueryMol() :
RDKit::RecursiveStructureQuery
getQueryMolecule() :
RDKit::FMCS::MaximumCommonSubgraph
getQueryType() :
RDKit::Atom
,
RDKit::QueryAtom
getRb0() :
RDKit::PeriodicTable
getRCOV() :
Data3Ddescriptors
getRcovalent() :
RDKit::PeriodicTable
getReactants() :
RDKit::ChemicalReaction
getReaction() :
RDKit::EnumerateLibraryBase
getReader() :
RDKit::MultiFPBReader
getReagents() :
RDKit::EnumerateLibrary
getReassignStereo() :
RDKit::MolStandardize::TautomerEnumerator
getRefDescriptor() :
RDKit::CIPLabeler::PairList
getRefIdx() :
RDKit::MolAlign::O3AConstraint
GetRelativeENeg() :
MolData3Ddescriptors
GetRelativeIonPol() :
MolData3Ddescriptors
GetRelativeMW() :
MolData3Ddescriptors
GetRelativePol() :
MolData3Ddescriptors
GetRelativeRcov() :
MolData3Ddescriptors
GetRelativeVdW() :
MolData3Ddescriptors
getRemoveBondStereo() :
RDKit::MolStandardize::TautomerEnumerator
getRemoveIsotopicHs() :
RDKit::MolStandardize::TautomerEnumerator
getRemoveSp3Stereo() :
RDKit::MolStandardize::TautomerEnumerator
getResidueName() :
RDKit::AtomPDBResidueInfo
getResidueNumber() :
RDKit::AtomPDBResidueInfo
getResultSize() :
RDKit::AtomPair::AtomPairArguments< OutputType >
,
RDKit::FingerprintArguments< OutputType >
,
RDKit::MorganFingerprint::MorganArguments< OutputType >
,
RDKit::RDKitFP::RDKitFPArguments< OutputType >
,
RDKit::TopologicalTorsion::TopologicalTorsionArguments< OutputType >
getRGroupData() :
RDKit::RGroupGa
getRGroupGA() :
RDKit::RGroupDecompositionChromosome
getRGroupLabels() :
RDKit::RGroupDecomposition
getRGroupsAsColumns() :
RDKit::RGroupDecomposition
getRGroupsAsRows() :
RDKit::RGroupDecomposition
getRingInfo() :
RDKit::ROMol
getRlabel() :
RDKit::RGroupDecompData
getRow() :
RDNumeric::Matrix< TYPE >
,
RDNumeric::SymmMatrix< TYPE >
getRowSol() :
RDKit::MolAlign::LAP
getRule6Ref() :
RDKit::CIPLabeler::Digraph
getRules() :
RDKit::CIPLabeler::Sort
getRvdw() :
RDKit::PeriodicTable
getScale() :
RDKit::MolDraw2D_detail::DrawMol
getSearchOrder() :
RDKit::SubstructLibrary
getSecondaryStructure() :
RDKit::AtomPDBResidueInfo
getSegmentNumber() :
RDKit::AtomPDBResidueInfo
getSerialNumber() :
RDKit::AtomPDBResidueInfo
,
RDKit::RecursiveStructureQuery
getSize() :
RDGeom::Grid3D
,
RDGeom::UniformGrid3D
getSmarts() :
RDKit::FragCatalogEntry
,
RDKit::MolChemicalFeatureDef
getSnapshot() :
RDKit::Trajectory
getSorter() :
RDKit::CIPLabeler::Rules
,
RDKit::CIPLabeler::SequenceRule
getSpacing() :
RDGeom::UniformGrid3D
getSparseCountFingerprint() :
RDKit::FingerprintGenerator< OutputType >
getSparseFingerprint() :
RDKit::FingerprintGenerator< OutputType >
getState() :
RDKit::EnumerateLibraryBase
getStereo() :
RDKit::Bond
getStereoAtoms() :
RDKit::Bond
getStereoGroups() :
RDKit::ROMol
getStringExtremes() :
RDKit::MolDraw2D
,
RDKit::MolDraw2D_detail::DrawText
getStringRects() :
RDKit::MolDraw2D_detail::DrawText
,
RDKit::MolDraw2D_detail::DrawTextFT
,
RDKit::MolDraw2D_detail::DrawTextJS
,
RDKit::MolDraw2D_detail::DrawTextSVG
getStringSize() :
RDKit::MolDraw2D
,
RDKit::MolDraw2D_detail::DrawText
,
RDKit::MolDraw2Dwx
getSymbol() :
RDKit::Atom
getTable() :
RDKit::PeriodicTable
getTag() :
RDKit::RDValue
getTanimoto() :
RDKit::FPBReader
getTanimotoNeighbors() :
RDKit::FPBReader
,
RDKit::MultiFPBReader
getTargetBondRings() :
RDKit::FMCS::RingMatchTableSet
getTautomers() :
RDKit::TautomerQuery
getTempFactor() :
RDKit::AtomPDBResidueInfo
getTemplateMolecule() :
RDKit::TautomerQuery
getText() :
RDKit::SDWriter
getTol() :
Queries::EqualityQuery< MatchFuncArgType, DataFuncArgType, needsConversion >
,
Queries::RangeQuery< MatchFuncArgType, DataFuncArgType, needsConversion >
getTolerance() :
RDKit::FragCatParams
getTopN() :
RDInfoTheory::InfoBitRanker
getTopology() :
RDKit::ROMol
getTotalDegree() :
RDKit::Atom
getTotalNumHs() :
RDKit::Atom
getTotalVal() :
RDKit::DiscreteValueVect
,
RDKit::SparseIntVect< IndexType >
getTotalValence() :
RDKit::Atom
getTransform() :
RDKit::MolStandardize::TautomerCatalogParams
getTransformation() :
RDKit::MolStandardize::TransformCatalogParams
getTransformations() :
RDKit::MolStandardize::TransformCatalogParams
getTransforms() :
RDKit::MolStandardize::TautomerCatalogParams
getTversky() :
RDKit::FPBReader
getTverskyNeighbors() :
RDKit::FPBReader
,
RDKit::MultiFPBReader
getType() :
ChemicalFeatures::ChemicalFeature
,
ChemicalFeatures::FreeChemicalFeature
,
RDFeatures::ExplicitFeature< FAMILYMARKER, TYPEMARKER, LOCTYPE >
,
RDFeatures::ImplicitFeature< FAMILYMARKER, TYPEMARKER, LOCTYPE >
,
RDKit::AtomKekulizeException
,
RDKit::AtomSanitizeException
,
RDKit::AtomValenceException
,
RDKit::KekulizeException
,
RDKit::MolChemicalFeature
,
RDKit::MolChemicalFeatureDef
,
RDKit::MolSanitizeException
getTypeLabel() :
Queries::Query< MatchFuncArgType, DataFuncArgType, needsConversion >
getTypeStr() :
RDCatalog::CatalogParams
GetUn() :
MolData3Ddescriptors
getUniqueAtomWithBookmark() :
RDKit::ROMol
getUniqueBondWithBookmark() :
RDKit::ROMol
getUpper() :
Queries::RangeQuery< MatchFuncArgType, DataFuncArgType, needsConversion >
getUpperBound() :
DistGeom::BoundsMatrix
getUpperFragLength() :
RDKit::FragCatParams
getUpperVolumeBound() :
DistGeom::ChiralSet
getVal() :
Queries::EqualityQuery< MatchFuncArgType, DataFuncArgType, needsConversion >
,
RDGeom::Grid3D
,
RDGeom::UniformGrid3D
,
RDKit::Dict
,
RDKit::DiscreteValueVect
,
RDKit::SparseIntVect< IndexType >
,
RDNumeric::Matrix< TYPE >
,
RDNumeric::SymmMatrix< TYPE >
,
RDNumeric::Vector< TYPE >
getValenceContrib() :
RDKit::Bond
,
RDKit::QueryBond
getValenceList() :
RDKit::PeriodicTable
getValIfPresent() :
RDKit::Dict
getValueType() :
RDKit::DiscreteValueVect
getVariationCounts() :
RDKit::MolEnumerator::LinkNodeOp
,
RDKit::MolEnumerator::MolEnumeratorOp
,
RDKit::MolEnumerator::PositionVariationOp
,
RDKit::MolEnumerator::RepeatUnitOp
getVDW() :
Data3Ddescriptors
getVersion() :
RDKit::Descriptors::PropertyFunctor
getVertices() :
RDKit::ROMol
getWeight() :
RDKit::MolAlign::O3AConstraint
getWrite2D() :
RDKit::TDTWriter
getWriteNames() :
RDKit::TDTWriter
getXSize() :
RDKit::FMCS::TArray2D< T >
getYSize() :
RDKit::FMCS::TArray2D< T >
greater() :
RDKit::Canon::bondholder
GreaterEqualQuery() :
Queries::GreaterEqualQuery< MatchFuncArgType, DataFuncArgType, needsConversion >
GreaterQuery() :
Queries::GreaterQuery< MatchFuncArgType, DataFuncArgType, needsConversion >
GridException() :
RDGeom::GridException
grow() :
RDKit::FMCS::Seed
Generated on Mon Aug 8 2022 17:09:27 for RDKit by
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